天文台表示， 6月首三周多雲、有驟雨，餘下大部分時間天晴、酷熱。6月較正常多雲，平均雲量為83%，較正常值多約6%；總日照時間為116.1小時，較正常值少約20%。

6月平均氣溫為28.6度，較正常值高0.3度。6月15日氣溫下降至全月最低的24度；6月28日錄得34.4度，為全月最高氣溫。

雨量方面，雖然荃灣、大埔和西貢區均錄得超過450毫米雨量，但全月雨量僅349.2毫米，較正常值少約29%。今年上半年累積雨量為1,054.5毫米，較同期正常值少約3%。

6月8日早上，天文台發出今年第二個紅色暴雨警告信號，當日新界部分地區嚴重水浸，西貢有山泥傾瀉報告，同日一名女子在大埔橫涌石澗遇上山洪暴發遭沖走後罹難。當日早上長洲附近出現水龍捲。

6月29日一個低壓區於南海中部發展為熱帶低氣壓，翌日早上增強為熱帶風暴「暹芭」，港島，九龍和新界東部錄得超過50毫米雨量。